Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms