Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
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NRF1Q16656 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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NRF1Q16656 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NRF1Q16656 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NRF1Q16656 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NRF1Q16656 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NRF1Q16656 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NRF1Q16656 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NRF1Q16656 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NRF1Q16656 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NRF1Q16656 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRF1Q16656 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRF1Q16656 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRF1Q16656 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRF1Q16656 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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