Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCSK7Q16549 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms