Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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CNGA3Q16281 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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CNGA3Q16281 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNGA3Q16281 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
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