Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN9AQ15858 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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