Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNB3Q15768 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms