Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMGN3Q15651 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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