Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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