Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RAB3GAP1Q15042 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3GAP1Q15042 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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