Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NR1D2Q14995 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1D2Q14995 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms