Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD4Q14839 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms