Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3AQ14563 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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