Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CKAP5Q14008 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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