Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
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KCNC3Q14003 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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KCNC3Q14003 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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KCNC3Q14003 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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KCNC3Q14003 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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KCNC3Q14003 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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KCNC3Q14003 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNC3Q14003 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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KCNC3Q14003 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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KCNC3Q14003 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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KCNC3Q14003 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNC3Q14003 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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