Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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