Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNW1Q13573 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNW1Q13573 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms