Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATRQ13535 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATRQ13535 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATRQ13535 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATRQ13535 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATRQ13535 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATRQ13535 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATRQ13535 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRQ13535 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRQ13535 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRQ13535 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRQ13535 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRQ13535 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRQ13535 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRQ13535 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRQ13535 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRQ13535 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRQ13535 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRQ13535 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRQ13535 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATRQ13535 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ATRQ13535 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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