Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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TUBB3Q13509 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TUBB3Q13509 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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TUBB3Q13509 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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TUBB3Q13509 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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TUBB3Q13509 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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TUBB3Q13509 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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TUBB3Q13509 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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TUBB3Q13509 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
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