Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SCGB2A2Q13296 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SCGB2A2Q13296 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SCGB2A2Q13296 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SCGB2A2Q13296 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SCGB2A2Q13296 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SCGB2A2Q13296 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SCGB2A2Q13296 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB2A2Q13296 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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