Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIN2BQ13224 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
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