Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALCOCO2Q13137 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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