Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRDNQ13061 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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