Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFX1Q12986 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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