Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms