Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FOXD4Q12950 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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FOXD4Q12950 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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FOXD4Q12950 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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FOXD4Q12950 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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