Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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