Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD300CQ08708 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms