Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms