Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms