Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms