Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms