Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRB3Q04118 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRB3Q04118 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms