Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNC4Q03721 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms