Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms