Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OC90Q02509 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OC90Q02509 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OC90Q02509 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OC90Q02509 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OC90Q02509 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OC90Q02509 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OC90Q02509 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OC90Q02509 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
OC90Q02509 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OC90Q02509 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OC90Q02509 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OC90Q02509 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OC90Q02509 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OC90Q02509 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OC90Q02509 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OC90Q02509 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OC90Q02509 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
OC90Q02509 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OC90Q02509 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms