Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN2Q02246 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CNTN2Q02246 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CNTN2Q02246 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNTN2Q02246 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CNTN2Q02246 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CNTN2Q02246 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNTN2Q02246 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN2Q02246 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms