Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAP1Q01518 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CAP1Q01518 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAP1Q01518 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAP1Q01518 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAP1Q01518 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAP1Q01518 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAP1Q01518 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAP1Q01518 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAP1Q01518 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAP1Q01518 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CAP1Q01518 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAP1Q01518 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAP1Q01518 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAP1Q01518 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CAP1Q01518 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms