Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK6Q00534 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms