Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL8P80075 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL8P80075 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL8P80075 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL8P80075 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL8P80075 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL8P80075 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL8P80075 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL8P80075 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL8P80075 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL8P80075 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL8P80075 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL8P80075 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL8P80075 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL8P80075 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL8P80075 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL8P80075 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL8P80075 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL8P80075 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL8P80075 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL8P80075 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL8P80075 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL8P80075 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL8P80075 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL8P80075 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL8P80075 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL8P80075 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL8P80075 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL8P80075 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL8P80075 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL8P80075 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL8P80075 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL8P80075 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL8P80075 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL8P80075 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL8P80075 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL8P80075 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL8P80075 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL8P80075 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL8P80075 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL8P80075 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL8P80075 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL8P80075 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL8P80075 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL8P80075 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL8P80075 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL8P80075 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL8P80075 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms