Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PHC1P78364 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PHC1P78364 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PHC1P78364 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHC1P78364 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHC1P78364 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHC1P78364 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms