Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RPS29P62273 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RPS29P62273 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RPS29P62273 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms