Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVK-21P61565 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-21P61565 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-21P61565 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-21P61565 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-21P61565 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-21P61565 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-21P61565 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-21P61565 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-21P61565 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-21P61565 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-21P61565 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-21P61565 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-21P61565 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-21P61565 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-21P61565 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-21P61565 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-21P61565 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-21P61565 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-21P61565 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVK-21P61565 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-21P61565 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms