Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SPCS3P61009 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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