Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms