Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BACE1P56817 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BACE1P56817 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BACE1P56817 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BACE1P56817 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BACE1P56817 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BACE1P56817 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BACE1P56817 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BACE1P56817 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BACE1P56817 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BACE1P56817 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BACE1P56817 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BACE1P56817 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BACE1P56817 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BACE1P56817 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BACE1P56817 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BACE1P56817 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BACE1P56817 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BACE1P56817 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BACE1P56817 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BACE1P56817 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BACE1P56817 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BACE1P56817 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BACE1P56817 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BACE1P56817 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BACE1P56817 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BACE1P56817 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BACE1P56817 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BACE1P56817 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BACE1P56817 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BACE1P56817 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BACE1P56817 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BACE1P56817 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BACE1P56817 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BACE1P56817 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BACE1P56817 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BACE1P56817 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BACE1P56817 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BACE1P56817 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BACE1P56817 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BACE1P56817 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BACE1P56817 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BACE1P56817 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BACE1P56817 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BACE1P56817 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BACE1P56817 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BACE1P56817 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BACE1P56817 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BACE1P56817 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BACE1P56817 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BACE1P56817 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BACE1P56817 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BACE1P56817 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BACE1P56817 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BACE1P56817 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BACE1P56817 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BACE1P56817 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BACE1P56817 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BACE1P56817 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BACE1P56817 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BACE1P56817 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
BACE1P56817 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BACE1P56817 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BACE1P56817 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms