Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NME5P56597 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NME5P56597 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NME5P56597 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms