Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAD23AP54725 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms