Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA2D1P54289 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms