Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MRE11P49959 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MRE11P49959 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRE11P49959 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRE11P49959 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms