Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTCFP49711 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTCFP49711 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTCFP49711 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTCFP49711 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTCFP49711 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTCFP49711 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTCFP49711 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTCFP49711 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTCFP49711 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTCFP49711 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTCFP49711 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTCFP49711 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTCFP49711 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTCFP49711 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTCFP49711 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTCFP49711 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTCFP49711 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTCFP49711 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTCFP49711 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTCFP49711 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTCFP49711 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTCFP49711 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTCFP49711 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTCFP49711 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTCFP49711 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTCFP49711 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTCFP49711 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTCFP49711 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTCFP49711 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTCFP49711 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTCFP49711 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTCFP49711 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTCFP49711 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTCFP49711 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTCFP49711 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTCFP49711 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTCFP49711 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTCFP49711 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTCFP49711 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTCFP49711 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTCFP49711 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTCFP49711 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTCFP49711 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTCFP49711 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTCFP49711 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTCFP49711 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTCFP49711 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTCFP49711 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTCFP49711 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTCFP49711 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTCFP49711 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTCFP49711 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CTCFP49711 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTCFP49711 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTCFP49711 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTCFP49711 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTCFP49711 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTCFP49711 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CTCFP49711 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTCFP49711 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTCFP49711 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTCFP49711 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTCFP49711 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTCFP49711 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTCFP49711 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTCFP49711 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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